Application de traitement de données racinaires Racine 2.1

Un logiciel de gestion de données racinaires obtenues par comptage d'impacts de racines...

RACINE2.1 est une application de traitement de données racinaires basée sur une méthode de comptage, sur le terrain, d’impacts de racines au travers d’une grille placée sur un profil de sol. Cette méthode permet de mesurer les intersections entre un plan représenté par ce profil de sol et les racines. Elle donne accès à la densité des impacts et à leur répartition spatiale (gradients, hétérogénéités). Puis, par modélisation, on peut estimer différentes caractéristiques du système racinaire (longueur racinaire, écart entre racines, taux d’exploration et leur répartition spatiale).

RACINE2.1 a été créé par J.L. Chopart, L. Le Mézo, J. Lindemann, M. Mézino et G. Sergent. La notice d'utilisation est téléchargeable ci-contre. Le logiciel peut être envoyé dans le cadre de collaborations scientifiques, sur demande adressée à L. Le Mézo (contact ci-contre). RACINE2.1, qui fonctionne sous Windows 8, est une évolution de la version antérieure RACINE2, qui ne fonctionne que jusqu'à la version Windows 7.

Les principes scientifiques détaillés de la démarche mise en oeuvre sont présentés dans les documents suivants :

  • Chopart J.L., 2002. Comment évaluer in situ les racines des cultures ? Guide pratique de différentes méthodes d'études racinaires. In Mémento de l'agronome, 2002. Ouvrage 1 691 p. (cédérom principal), CIRAD, GRET, Ministères des Affaires étrangères, France.
  • Chopart J.L., 2004. Les systèmes racinaires des cultures tropicales : rôle, méthodes d’étude in situ, développement, fonctionnement. Doc. CIRAD Réunion, 7, ch. de l’Irat, St Pierre, La Réunion, 42 p.
  • Chopart JL, Le Mézo L, Mézino M., 2008. RACINE2 Logiciel de gestion de données racinaires obtenues à partir de comptages sur profils de sol. Notice d’utilisation. Note scientifique Cirad URSCA 23 p.
  • Chopart J.L, Rodrigues S.R., Azevedo M., Medina C., 2008. Estimating sugarcane root length density through root mapping and orientation modelling. Plant Soil, vol. 138
  • Chopart J.L., Sine B., Dao A., Muller B, 2008. Root orientation of four sorghum cultivars: application to estimate root length density from root counts in soil profiles. Plant Root 2 67-75.
  • Chopart, JL, Le Mézo L., Mézino M. 2009 RACINE2: A software application for processing spatial distribution of root length density from root intersections on trench profiles. Comm. orale congrès ISSR (Int. Soc. of Root Research) ROOTRAP (Root Res. and Applications) Sept. 2-4 Vienna (Autriche)
  • Chopart J.L, Le Mézo L., Vauclin M. 2012.  Modelling the potential root water extraction ratio in soil: application to sugar cane on the Island of Réunion. In: proceedings of 8th Symposium Int. Society Root Research, Dundee (GB) ISRR Edit.